More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0566 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  100 
 
 
206 aa  400  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  62.69 
 
 
202 aa  259  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  64.71 
 
 
204 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  64.8 
 
 
206 aa  248  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  61.27 
 
 
204 aa  248  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  63.55 
 
 
206 aa  239  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  44.05 
 
 
198 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  42.63 
 
 
222 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  44 
 
 
217 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  35.32 
 
 
219 aa  141  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  43.43 
 
 
219 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.51 
 
 
201 aa  137  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  41.49 
 
 
216 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  39.6 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 
220 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  38.07 
 
 
221 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  41.42 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  42.01 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  47.83 
 
 
262 aa  134  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  41.71 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  43.93 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  42.77 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  42.07 
 
 
268 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  40.93 
 
 
220 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  40.57 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  39.2 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  38.14 
 
 
219 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.14 
 
 
219 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  38.14 
 
 
219 aa  131  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  38.14 
 
 
219 aa  131  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  41.04 
 
 
219 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  38.14 
 
 
219 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  38.14 
 
 
219 aa  131  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  42.07 
 
 
220 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  42.07 
 
 
220 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  42.07 
 
 
220 aa  131  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  38.35 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  40.56 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  39.81 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  37.56 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  37.76 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  36.98 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  40.34 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  37.38 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  37.02 
 
 
219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  40.84 
 
 
218 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  43.48 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  40.62 
 
 
213 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  41.62 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.34 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  40.43 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  43.35 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  42.01 
 
 
223 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  39.23 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  40.53 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  40.31 
 
 
214 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  38.76 
 
 
237 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  39.27 
 
 
215 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  37.23 
 
 
237 aa  124  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  41.12 
 
 
226 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  41.12 
 
 
226 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  41.49 
 
 
215 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  38.8 
 
 
216 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  39.63 
 
 
202 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  41.12 
 
 
226 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  41.12 
 
 
226 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  41.12 
 
 
242 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  41.12 
 
 
226 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  36.32 
 
 
244 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  41.12 
 
 
283 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  38.74 
 
 
215 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  39.02 
 
 
202 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  40.66 
 
 
220 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  39.88 
 
 
213 aa  121  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  43.71 
 
 
234 aa  121  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  38.15 
 
 
222 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  42.01 
 
 
229 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  43.09 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  42.02 
 
 
227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  39.9 
 
 
215 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  40.53 
 
 
216 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  41.42 
 
 
223 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  42.55 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  42.55 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  42.69 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  40 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  38.06 
 
 
363 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  35.59 
 
 
245 aa  118  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  40.35 
 
 
216 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  37.87 
 
 
229 aa  117  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>