More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1653 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1453  hypothetical protein  54.85 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  43.84 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  47.03 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  41.97 
 
 		 363 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  38.81 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  37.33 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  39.42 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  39.58 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  39.68 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  34.43 
 
 		 249 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 223 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  43.58 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4407  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.81 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  43.58 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  37.79 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  42.94 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  39.07 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  42.33 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.8 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  42.11 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  42.08 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  40.82 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  38.42 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  40.53 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  35.41 
 
 		 277 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  35.98 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  41.85 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  39.89 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  41.11 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  39.72 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  39.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  39.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  40.96 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  39.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  39.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  39.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  38.42 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  36.7 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.76 
 
 		 458 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  41.14 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  38.3 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  40.66 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  40.13 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  39.61 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.4 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.86 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  41.4 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  38.71 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  37.86 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  33.17 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  40.96 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  36.87 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  38.2 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  38.3 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  36.82 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  42.37 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  38.53 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  41.14 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.64 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  32.68 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  38.58 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  39.76 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  38.86 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  38.86 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  43.83 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  43.83 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  43.83 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  37.64 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  37.56 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  39.22 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  35.82 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  37.89 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  39.89 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  39.06 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  36.82 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  34.91 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.67 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  33.85 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  40.13 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  36.2 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  38.95 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  37.24 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  35.02 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>