More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0179 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 229 aa  460  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  58.95 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  63.59 
 
 		 226 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  48.68 
 
 		 244 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  41.9 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  45.55 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  48.4 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  44.05 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  40.97 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  46.08 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  45.59 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  45.74 
 
 		 363 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  41.2 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.39 
 
 		 201 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  39.81 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.11 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  36.97 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  41.78 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  38.03 
 
 		 221 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  45.86 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  39.06 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  38.39 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.71 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.13 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.95 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  37.86 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  38.95 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  37.29 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.49 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  38.75 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  38.07 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  35.91 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  43.55 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  38.55 
 
 		 202 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  35.32 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  38.34 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.89 
 
 		 458 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  38.34 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  38.34 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  38.34 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1453  hypothetical protein  37.64 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  38.34 
 
 		 219 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  42.44 
 
 		 234 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  35.81 
 
 		 247 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  39.47 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  39.47 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  36.92 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  39.9 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  36.22 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  39.67 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.19 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  39.13 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  38.95 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  40.84 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  37.84 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.84 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  37.84 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  37.84 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  37.84 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  37.84 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  37.57 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  38.5 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  37.86 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  37.7 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  38.6 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  33.33 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  37.84 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  37.3 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  36.46 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  40.48 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  32.83 
 
 		 202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  37.3 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  36.87 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  38.5 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  36.53 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  36.63 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  37.43 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  36.53 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  36.87 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  40 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  38.5 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  39.51 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  33.18 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  35.75 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  39.26 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  37.07 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  38.92 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.12 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>