More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3307 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  99.17 
 
 
242 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  95.85 
 
 
253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  99.12 
 
 
226 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  99.12 
 
 
226 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  99.12 
 
 
226 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  99.56 
 
 
226 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  99.12 
 
 
226 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  84.58 
 
 
227 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  83.55 
 
 
244 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  83.55 
 
 
244 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  83.33 
 
 
244 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  83.26 
 
 
227 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  78.48 
 
 
223 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  81.58 
 
 
257 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  81.58 
 
 
257 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  78.48 
 
 
223 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  76.89 
 
 
229 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  65.58 
 
 
212 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  66.22 
 
 
219 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  64.65 
 
 
215 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  64.19 
 
 
215 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  63.43 
 
 
218 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  60.09 
 
 
214 aa  258  9e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  60.19 
 
 
213 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  49.54 
 
 
213 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  48.23 
 
 
224 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  53.08 
 
 
213 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  47.53 
 
 
219 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  50.24 
 
 
219 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  50.24 
 
 
219 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  49.76 
 
 
219 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  49.76 
 
 
219 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  49.76 
 
 
219 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  47.09 
 
 
219 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  49.76 
 
 
219 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  47.09 
 
 
219 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  47.09 
 
 
219 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  49.76 
 
 
219 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  49.76 
 
 
219 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  47.09 
 
 
219 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  47.25 
 
 
220 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  52.5 
 
 
221 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  48.42 
 
 
219 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  49.76 
 
 
219 aa  208  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  47.3 
 
 
220 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  48.65 
 
 
218 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  51.5 
 
 
221 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  50.48 
 
 
216 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  47.29 
 
 
217 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  48.44 
 
 
222 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  48.29 
 
 
221 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  48.8 
 
 
222 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  45.87 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  46.78 
 
 
244 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  44.89 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  44.89 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  44.89 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  46.58 
 
 
213 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  47.32 
 
 
218 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  47.06 
 
 
232 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  46.83 
 
 
218 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  51.64 
 
 
215 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  53.3 
 
 
215 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  44.55 
 
 
219 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  46.12 
 
 
215 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  46.12 
 
 
215 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  45.29 
 
 
230 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  50.72 
 
 
216 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  44.84 
 
 
221 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  43.11 
 
 
220 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  50.7 
 
 
215 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  46.67 
 
 
218 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  52.79 
 
 
215 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  46.43 
 
 
262 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  46.76 
 
 
215 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  46.76 
 
 
215 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  44.84 
 
 
219 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  48.62 
 
 
216 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  52.28 
 
 
215 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  52.28 
 
 
215 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5807  SNARE associated Golgi protein  46.08 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468515  normal  0.433949 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  47.42 
 
 
220 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  44.69 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  46.7 
 
 
214 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  41.63 
 
 
237 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  40.55 
 
 
211 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  46.7 
 
 
214 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  42.6 
 
 
216 aa  179  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  43.38 
 
 
220 aa  178  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  42.27 
 
 
245 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  42.92 
 
 
220 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 
218 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  47.87 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  43.91 
 
 
237 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  42.86 
 
 
219 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  44.62 
 
 
214 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  41.44 
 
 
230 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  45.5 
 
 
217 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  39.61 
 
 
201 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>