More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4379 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  460  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  58.41 
 
 
256 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  56.9 
 
 
259 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  53 
 
 
268 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  54.55 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  52.25 
 
 
286 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  47.64 
 
 
277 aa  204  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  47.55 
 
 
249 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  50.96 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  50.96 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  48.78 
 
 
228 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  46.52 
 
 
221 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.54 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  44.6 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  43.68 
 
 
219 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  42.59 
 
 
235 aa  168  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  43.68 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  43.68 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  43.68 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  43.16 
 
 
219 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.86 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  43.52 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  45 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  41.97 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  44.81 
 
 
219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  43.17 
 
 
219 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.17 
 
 
219 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  43.17 
 
 
219 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  43.17 
 
 
219 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  43.17 
 
 
219 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  43.17 
 
 
219 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  45.91 
 
 
236 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  43.72 
 
 
219 aa  161  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  43.01 
 
 
220 aa  161  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  45.41 
 
 
213 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  42.41 
 
 
246 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  42.29 
 
 
222 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  43.17 
 
 
219 aa  158  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.19 
 
 
248 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.89 
 
 
458 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  41.45 
 
 
221 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  43.59 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  41.62 
 
 
221 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  44.56 
 
 
230 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  40.82 
 
 
232 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  47.62 
 
 
244 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  40.69 
 
 
219 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  42.5 
 
 
222 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  40.22 
 
 
221 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  40.49 
 
 
220 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  35.61 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  40.96 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  43.33 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  40.41 
 
 
220 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.9 
 
 
201 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  40.41 
 
 
220 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  44.09 
 
 
231 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  40.41 
 
 
220 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  44.09 
 
 
231 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  42.13 
 
 
220 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  44.09 
 
 
231 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  39.13 
 
 
221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  51.75 
 
 
198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  40.53 
 
 
219 aa  144  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  39.49 
 
 
216 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.61 
 
 
209 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  42.35 
 
 
220 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  42.35 
 
 
220 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  42.02 
 
 
213 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  39.81 
 
 
247 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  39.89 
 
 
215 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  43.69 
 
 
244 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  36.7 
 
 
211 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  41.94 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  38.71 
 
 
218 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.86 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  37.82 
 
 
215 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  39.47 
 
 
216 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  37.82 
 
 
215 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  40.2 
 
 
215 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  44.77 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  41.01 
 
 
215 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  42.71 
 
 
237 aa  135  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  40.86 
 
 
216 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 
224 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  37.89 
 
 
215 aa  134  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  38.89 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  44.9 
 
 
202 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  45.45 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  40.34 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  40 
 
 
252 aa  132  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  39.13 
 
 
215 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  38.5 
 
 
221 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  38.33 
 
 
218 aa  131  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  44.22 
 
 
202 aa  131  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  37.22 
 
 
218 aa  131  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.15 
 
 
229 aa  131  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  37.18 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  42.33 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>