More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0751 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  96.41 
 
 		 223 aa  400  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  82.06 
 
 		 227 aa  360  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  85.14 
 
 		 229 aa  359  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  78.03 
 
 		 253 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  78.92 
 
 		 226 aa  341  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  83.41 
 
 		 227 aa  341  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  78.48 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  78.48 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  78.48 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  78.48 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  78.48 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  78.03 
 
 		 242 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  82.06 
 
 		 244 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  82.06 
 
 		 244 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  83.11 
 
 		 244 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  79.82 
 
 		 257 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  80.82 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  67.14 
 
 		 212 aa  291  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  66.06 
 
 		 219 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  62.84 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  61.64 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  61.64 
 
 		 215 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  63.3 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  62.5 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  53 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  48.15 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  52.5 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  51.22 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  50.48 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  50.48 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  50.48 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  50.48 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  49.32 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  50.48 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  48.87 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  50.48 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  46.93 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  48.87 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  48.87 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  48.87 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  48.42 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  50.24 
 
 		 219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  45.98 
 
 		 220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  46.88 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  51.66 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  49.76 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  46.61 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  49.09 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  48.67 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  44.8 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  48.15 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  48.28 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  47.47 
 
 		 215 aa  204  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  48.56 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  47.6 
 
 		 220 aa  204  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  47.91 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  47.85 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  49.05 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  53.03 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  49.28 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  45.87 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  45.41 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  45.45 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  44.2 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  44.2 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  44.2 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  46.51 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  47.98 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  50.24 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  46.3 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  42.99 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  44.98 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  53.03 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5807  SNARE associated Golgi protein  47.22 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468515  normal  0.433949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  44.98 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  51.27 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  52.02 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  52.02 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  51.49 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  51.49 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  45 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  45 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  43.5 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  43.05 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  40.72 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  42.29 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  45.45 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  45.13 
 
 		 262 aa  181  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  47.34 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  45.07 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  41.55 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4005  hypothetical protein  47.66 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  41.82 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.08 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  40.74 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  44.39 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  45.97 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>