More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2311 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  87.5 
 
 
256 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  56.44 
 
 
363 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  46.15 
 
 
249 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  56.9 
 
 
234 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  53.02 
 
 
268 aa  218  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  53.54 
 
 
237 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  53.54 
 
 
237 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  48.12 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  47.12 
 
 
228 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.22 
 
 
286 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  45.11 
 
 
235 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.05 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.85 
 
 
458 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  43.68 
 
 
221 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  44.33 
 
 
246 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  44.39 
 
 
220 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  47.14 
 
 
227 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  44.56 
 
 
219 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  43.54 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.54 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  43.54 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  43.54 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  43.54 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  43.54 
 
 
219 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  44.5 
 
 
219 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  45.08 
 
 
220 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  45.36 
 
 
221 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  43.68 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  48.09 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  47.83 
 
 
198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  50.57 
 
 
223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  41.15 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.99 
 
 
201 aa  161  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  41.15 
 
 
219 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  40.58 
 
 
220 aa  161  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  40.98 
 
 
221 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  40.67 
 
 
219 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  45.13 
 
 
230 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  41.18 
 
 
236 aa  158  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  43.85 
 
 
213 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  40.98 
 
 
221 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  43.41 
 
 
216 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  42.61 
 
 
218 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.92 
 
 
239 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  42.46 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  45.51 
 
 
213 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  42.05 
 
 
218 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  38.53 
 
 
232 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  42.2 
 
 
220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  42.2 
 
 
220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  42.2 
 
 
220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  38.31 
 
 
217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  44.5 
 
 
218 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  40.72 
 
 
232 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  47.54 
 
 
214 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  44.32 
 
 
244 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 
215 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  40.28 
 
 
241 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  41.12 
 
 
222 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.26 
 
 
209 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  43.6 
 
 
219 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.51 
 
 
229 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 
215 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  40.86 
 
 
213 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  44.19 
 
 
220 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  41.48 
 
 
244 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  40.38 
 
 
221 aa  149  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  42.41 
 
 
218 aa  148  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.89 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  42 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.95 
 
 
216 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  40.3 
 
 
230 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  44.02 
 
 
202 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  41.33 
 
 
216 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  39 
 
 
220 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  39.29 
 
 
245 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  38.58 
 
 
224 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  42.46 
 
 
215 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  39.59 
 
 
215 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  44.59 
 
 
202 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  39.78 
 
 
214 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  43.92 
 
 
202 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.72 
 
 
248 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  38.16 
 
 
247 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  39.18 
 
 
216 aa  143  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  37.44 
 
 
219 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  41.9 
 
 
215 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  37.61 
 
 
227 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  39.3 
 
 
212 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  41.9 
 
 
215 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  40.5 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  41.99 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  41.99 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  41.99 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  42.25 
 
 
215 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>