More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2971 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 
286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  67.26 
 
 
277 aa  295  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  55.56 
 
 
363 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  51.67 
 
 
268 aa  225  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  56.06 
 
 
237 aa  225  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  55.05 
 
 
237 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  48.84 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.37 
 
 
240 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  43.48 
 
 
259 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  46.89 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  46.46 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  46.08 
 
 
220 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  47.21 
 
 
219 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  47.21 
 
 
219 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  47.21 
 
 
219 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  47.21 
 
 
219 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  47.72 
 
 
219 aa  194  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  48.06 
 
 
227 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  47.89 
 
 
236 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  45.59 
 
 
221 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  46.7 
 
 
219 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  47.94 
 
 
219 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  49.51 
 
 
246 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  46.19 
 
 
220 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  46.91 
 
 
219 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  47.76 
 
 
221 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  46.39 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  46.39 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  46.39 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  46.39 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  46.39 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  46.39 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  46.91 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  52.25 
 
 
234 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  48.44 
 
 
220 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  48.44 
 
 
220 aa  186  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  48.44 
 
 
220 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  44.67 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.77 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.71 
 
 
239 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  45.41 
 
 
231 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  45.41 
 
 
231 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  45.41 
 
 
231 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  43.33 
 
 
232 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  43.52 
 
 
218 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  42.5 
 
 
222 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  42.93 
 
 
219 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  43.01 
 
 
218 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  44.5 
 
 
221 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  42.5 
 
 
218 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  43.33 
 
 
235 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  42.78 
 
 
230 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  42.08 
 
 
224 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  41.09 
 
 
217 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  41.78 
 
 
220 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 
244 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  43.98 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  49.4 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  42.19 
 
 
218 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  44.67 
 
 
218 aa  165  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  43.15 
 
 
219 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  43.75 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  50.29 
 
 
223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.59 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.75 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.74 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  43.43 
 
 
213 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  38.76 
 
 
247 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  44.12 
 
 
212 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  40.78 
 
 
245 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  45.56 
 
 
216 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  43.15 
 
 
214 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  47.21 
 
 
198 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  41 
 
 
215 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  48.95 
 
 
222 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  42.21 
 
 
220 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  48.37 
 
 
237 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  43.72 
 
 
213 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.88 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  39.71 
 
 
237 aa  155  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  43.14 
 
 
227 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  44.5 
 
 
216 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  40.82 
 
 
213 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  40.31 
 
 
215 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  42.58 
 
 
253 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  39.8 
 
 
215 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  41.12 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  39.18 
 
 
214 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  43.37 
 
 
219 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  41.71 
 
 
227 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  39.49 
 
 
215 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  42.62 
 
 
215 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  38.14 
 
 
214 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  41.54 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  43.23 
 
 
222 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  42.29 
 
 
220 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  43.98 
 
 
216 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  43.46 
 
 
215 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>