More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3131 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  879    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  86.3 
 
 		 473 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  36.76 
 
 		 223 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  35.43 
 
 		 211 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  37.14 
 
 		 221 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 		 256 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.72 
 
 		 200 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  35.87 
 
 		 203 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  94  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  38.42 
 
 		 218 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  29.52 
 
 		 677 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6733  membrane protein, DedA family  34.83 
 
 		 214 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  37.2 
 
 		 222 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  36.99 
 
 		 230 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.96 
 
 		 198 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.91 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  29.61 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  32.6 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  33.55 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  35.62 
 
 		 222 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 		 229 aa  82.4  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.53 
 
 		 217 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  34.02 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  34.19 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.97 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  36.6 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  36.6 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.88 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  24.35 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.12 
 
 		 702 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.19 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.91 
 
 		 668 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  32.7 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  32.88 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  32.69 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  34.25 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  32.67 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  31.97 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  34.03 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.51 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  27.88 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.77 
 
 		 664 aa  76.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  33.33 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4631  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.73 
 
 		 213 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  31.69 
 
 		 218 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  35.47 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  31.76 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  31.15 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.82 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.82 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  35.1 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  32.84 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.82 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.66 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  32.09 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.41 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  27.33 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  32.64 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  30.77 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  32.65 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  34.69 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  32.09 
 
 		 219 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  29.14 
 
 		 218 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  27.86 
 
 		 215 aa  72.8  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  33.85 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.78 
 
 		 201 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.27 
 
 		 211 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  31.48 
 
 		 209 aa  72.4  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.57 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  30.82 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  32.19 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  30.52 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  27.41 
 
 		 695 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  32.24 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  30.51 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>