More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3995 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 312 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  53.29 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  39.87 
 
 		 334 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  43.13 
 
 		 330 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  43.13 
 
 		 330 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  43.13 
 
 		 330 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  39.68 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  41.23 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  40.58 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  42.17 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  42.53 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  39.42 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  40.45 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  41.72 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  39.35 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  36.69 
 
 		 334 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  38.96 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  37.15 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  39.03 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  37.97 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  37.97 
 
 		 348 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  37.97 
 
 		 362 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  37.97 
 
 		 362 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  37.97 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  37.97 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  37.97 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  37.19 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  35.59 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  35.33 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  35.14 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  35.14 
 
 		 373 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  35.14 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  35.14 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  35.33 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  35.14 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  36.81 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 351 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  36.07 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  37.94 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  35.19 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  38.3 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  33.55 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  33.79 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.16 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.34 
 
 		 676 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  32 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.03 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  32.83 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 686 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  30.72 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  27.33 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  27.78 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  29.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  25.73 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  28.95 
 
 		 681 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  24.83 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  30.07 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  28.25 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  31.62 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  34.52 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0530  dedA family protein  25 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0394  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0390  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.9 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  34.69 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0461  dedA family protein  25 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0531  dedA family protein  25 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  26.75 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.66 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.66 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.66 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.07 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  33.9 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  30.82 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0403  dedA family protein  25.15 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  25 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0415  DedA family protein  25.15 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  24.71 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  29.93 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  33.93 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  28.19 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  25.14 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>