More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0684 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  67.89 
 
 		 243 aa  316  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  69.91 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  55.09 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  58.06 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  44.04 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  38.79 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  38.79 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  38.32 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  38.32 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  38.32 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  42.53 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  41.95 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  37.44 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  41.95 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  38.54 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  36.57 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  36.57 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  39.33 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  37.91 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  37.91 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  37.91 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  37.91 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  37.91 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  36.19 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.11 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  40.35 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  38.2 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  34.12 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  37.36 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  36.52 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  37.08 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  36.21 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.78 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  36.26 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  33.95 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  33.95 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  30.56 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.26 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  29.12 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  27.22 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  31 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  31 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  27.57 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.72 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  32.03 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  32.78 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  27.32 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  25.91 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  30.27 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  30.27 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  32.78 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  26.86 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  27.57 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  29.73 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.78 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.87 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  29.73 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  29.73 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  29.73 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  29.73 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  26.17 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  26.83 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  28.65 
 
 		 253 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.88 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  26.22 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.92 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.92 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.92 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.92 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.92 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.92 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  27.93 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>