More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3511 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  99.54 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  93.61 
 
 		 219 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  87.21 
 
 		 219 aa  377  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  70.7 
 
 		 220 aa  309  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  70.78 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  71.23 
 
 		 219 aa  299  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  68.49 
 
 		 219 aa  293  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  64.35 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  64.35 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  64.35 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  63.89 
 
 		 220 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  63.89 
 
 		 220 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  70.23 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  70.23 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  70.23 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  71.58 
 
 		 220 aa  281  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  65.14 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  63.76 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  63.3 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  62.79 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  62.79 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  62.79 
 
 		 232 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  59.07 
 
 		 227 aa  264  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  62.5 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  59.53 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  59.53 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  62.11 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  53.49 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  36.41 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  37.91 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  34.72 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  36.97 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  34.83 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  33.01 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  32.64 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  36.47 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  34.5 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  33.33 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  34.57 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  34.04 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.17 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  32.75 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  33.71 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  36.48 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  35.91 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  32.7 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  36.31 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.95 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  31.58 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  33.33 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.51 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  31.58 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  33.87 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  33 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  36.61 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  33.89 
 
 		 241 aa  91.7  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.87 
 
 		 286 aa  91.7  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  29.82 
 
 		 244 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  36.63 
 
 		 277 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  38.33 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  35.23 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  38.33 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  38.33 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  38.33 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  38.33 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  38.33 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  36.98 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  36.31 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  34.15 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.53 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>