More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0690 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  99.54 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  94.52 
 
 		 219 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  94.06 
 
 		 219 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  86.3 
 
 		 219 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  67.12 
 
 		 220 aa  304  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  69.86 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  70.78 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  68.04 
 
 		 219 aa  296  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  71.58 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  70.23 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  70.23 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  70.23 
 
 		 220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  63.43 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  63.43 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  63.43 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  62.96 
 
 		 220 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  62.96 
 
 		 220 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  63.72 
 
 		 232 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  63.72 
 
 		 232 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  63.72 
 
 		 232 aa  271  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  60.47 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  64.22 
 
 		 223 aa  268  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  61.93 
 
 		 220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  61.47 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  61.11 
 
 		 220 aa  262  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  59.07 
 
 		 224 aa  257  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  60.93 
 
 		 227 aa  255  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  62.11 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  53.95 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  36.11 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  37.09 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  37.85 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  33.98 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  36.19 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  34.26 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  34.03 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  33.82 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  34.44 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  34.03 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  36.42 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  34.57 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  36.47 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  31.94 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  37.65 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  35.59 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  33.33 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  35.36 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  32.7 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  36.14 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  31.94 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  32.98 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  34.44 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.48 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  32.16 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  32.77 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 244 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  35.18 
 
 		 253 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  36.48 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  36.08 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  36.31 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  33.97 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  30.5 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  36.22 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  36.22 
 
 		 283 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  31.89 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  36.22 
 
 		 242 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  36.22 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  36.22 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  36.22 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  36.22 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  31.94 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  30.73 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  35.59 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  35.59 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.39 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>