More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0526 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  94.69 
 
 		 227 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  82.82 
 
 		 224 aa  361  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  80 
 
 		 232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  80 
 
 		 232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  80 
 
 		 232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  81.61 
 
 		 223 aa  351  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  75 
 
 		 220 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  75 
 
 		 220 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  74.55 
 
 		 220 aa  343  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  74.55 
 
 		 220 aa  343  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  74.55 
 
 		 220 aa  343  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  84.26 
 
 		 224 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  75.91 
 
 		 220 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  75.45 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  73.64 
 
 		 220 aa  319  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  62.73 
 
 		 220 aa  287  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  65.28 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  63.89 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  63.43 
 
 		 219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  60.93 
 
 		 219 aa  271  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  62.84 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  62.84 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  62.84 
 
 		 220 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  63.89 
 
 		 216 aa  268  4e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  60 
 
 		 220 aa  261  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  60.93 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  59.53 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  59.53 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  59.53 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  59.53 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  57.21 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  59.07 
 
 		 219 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  36.62 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  36.74 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  37.5 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  39.88 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  35.43 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  32.26 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  34.23 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  31.42 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  33.18 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  34.39 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  35.86 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  35.35 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  31.56 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  34.15 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  36.59 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  36.59 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  36.59 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  36.59 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  36.59 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  36.59 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  36.59 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.86 
 
 		 217 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.04 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  32.13 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  31.72 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  32 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  35.24 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  34.82 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.19 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  35.33 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  38.46 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  34.13 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  34.64 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  33.17 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  38.46 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  31.92 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  33.17 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  34.64 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  32.14 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  31.53 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  38.46 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  31.58 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  33.04 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  31.96 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  33.65 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  36.59 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  28.51 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>