More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1720 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  37.67 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  37.67 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  37.9 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  37.67 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  37.67 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  37.67 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.86 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  38.14 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  36.65 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  37.7 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  37.7 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.72 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  35.45 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  34.74 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  35.07 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  30.56 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  27.7 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  30 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  32.63 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  25.57 
 
 		 233 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.21 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.82 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.1 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  27.27 
 
 		 241 aa  84.7  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  29.73 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  33.49 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  26.82 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  30.07 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  30.05 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  28.22 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  30.07 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  28.7 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.03 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  26.98 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5807  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468515  normal  0.433949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  28.88 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  31.03 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  26.94 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.94 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  26.94 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  26.94 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.94 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  26.11 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  26.94 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  25.66 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.8 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  28.41 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  29.33 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  27.32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  25.66 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  25.66 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  27.27 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  31.87 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  31.87 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  26.75 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  30.57 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  26.2 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  27.42 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.92 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>