More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0487 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  76.96 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  83.71 
 
 		 223 aa  355  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  82.35 
 
 		 227 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  75.69 
 
 		 220 aa  347  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  75.69 
 
 		 220 aa  347  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  75.69 
 
 		 220 aa  347  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  75.23 
 
 		 220 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  75.23 
 
 		 220 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  76.02 
 
 		 224 aa  334  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  78.6 
 
 		 220 aa  332  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  78.6 
 
 		 220 aa  331  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  76.74 
 
 		 220 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  77.78 
 
 		 224 aa  316  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  63.59 
 
 		 220 aa  289  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  65.9 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  64.52 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  63.72 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  64.06 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  63.76 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  63.76 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  62.73 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  63.76 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  62.5 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  63.72 
 
 		 219 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  62.79 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  62.79 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  62.79 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  62.79 
 
 		 219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  61.4 
 
 		 219 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  62.33 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  38.99 
 
 		 222 aa  148  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  34.51 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  36.41 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  33.18 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  33.33 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  38.65 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  35.5 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  37.23 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  38.66 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  35.4 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  34.51 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  36.67 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.4 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  36.16 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  38.16 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  34.69 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  37.68 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  37.68 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  37.68 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  37.68 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  34.9 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  37.68 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  37.14 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  34.92 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  36.78 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  34.38 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  34.98 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  34.98 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  36.71 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  33.48 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  35.79 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  36.14 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  34.83 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  34.83 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  32.56 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 		 201 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  36.77 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  30.59 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  30.67 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  35.18 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  35.48 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  38.01 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  36.25 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  35.78 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  34.36 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>