More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06156 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  81.7 
 
 		 226 aa  360  9e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  57.71 
 
 		 233 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  58.06 
 
 		 222 aa  254  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  56.48 
 
 		 243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  43.75 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  37.79 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  37.79 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  42.7 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  37.79 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  37.79 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  37.79 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  42.13 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  42.13 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.98 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  34.74 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  40.12 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  38.37 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  38.37 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  38.37 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  38.2 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  35.55 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  34.27 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  34.27 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  34.27 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  34.27 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  38.76 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  34.27 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.83 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  33.93 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  33.93 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  33.93 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  37.21 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  31.4 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  30.15 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  26.17 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  26.76 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  30.51 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.3 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  29 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  28.89 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  28.76 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  29.93 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  28.03 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  27.32 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  31.01 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  25.12 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.03 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  31.03 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  27.54 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  26.42 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  31.03 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  22.63 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  32.07 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  27.44 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  28.81 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  26.44 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  28.18 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  26.75 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  24.02 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  24.88 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  30.98 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  25.34 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  26.03 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.38 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  26.9 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  27.5 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>