More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1922 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  42.65 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  42.46 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  44.1 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  41.34 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  41.34 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  40.54 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.54 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  40.54 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  40.54 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  40.54 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  40.54 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  45.99 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  39.38 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  40.38 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  46.03 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  41.67 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  44.69 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  46.39 
 
 		 279 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  45.64 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  47.69 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  36.79 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  39.38 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  45.83 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  43.23 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  41.97 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  41.97 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  41.97 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.66 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  41.71 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  44.62 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  46.74 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  40.66 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  42.39 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  40.41 
 
 		 227 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  43.75 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  38.97 
 
 		 237 aa  147  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  39.58 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  44.97 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  40.4 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  43.96 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  40.88 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  38.54 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  41.27 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  44.56 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  39.89 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  41.24 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  41.45 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  42.25 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  40.72 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  41.97 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  42.08 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  41.18 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  40.21 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  43.68 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  39.06 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  43.75 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  40.21 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  40.21 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  40.21 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  40.21 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  40.21 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  40.21 
 
 		 283 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  41.15 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  36.18 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  42.86 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  39.57 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  41.8 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  39.57 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  41.58 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  43.65 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  39.38 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  40 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  35.44 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  37.82 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  40.89 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  41.54 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  40.59 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  37.31 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  40.55 
 
 		 259 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.27 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  39.9 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  39.52 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  39.06 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  36.98 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  41.75 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  42.55 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  39.9 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  40.62 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  38.66 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  39.06 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  39.9 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  39.9 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>