More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0270 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  76.5 
 
 
219 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  75.12 
 
 
219 aa  327  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  71.89 
 
 
220 aa  324  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  76.36 
 
 
220 aa  323  9e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  76.5 
 
 
219 aa  323  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  69.77 
 
 
219 aa  301  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  71.57 
 
 
219 aa  288  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  68.84 
 
 
219 aa  288  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  70.23 
 
 
219 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  70.23 
 
 
219 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  70.23 
 
 
219 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  70.23 
 
 
219 aa  284  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  69.77 
 
 
219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  61.01 
 
 
220 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  61.01 
 
 
220 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  61.01 
 
 
220 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  60.73 
 
 
227 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  63.76 
 
 
232 aa  278  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  63.76 
 
 
232 aa  278  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  60.55 
 
 
220 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  60.55 
 
 
220 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  63.76 
 
 
232 aa  278  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  65.44 
 
 
223 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  62.96 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  62.84 
 
 
227 aa  267  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  61.4 
 
 
220 aa  256  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  62.96 
 
 
224 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  60.93 
 
 
220 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  60.73 
 
 
220 aa  245  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  56.02 
 
 
216 aa  234  6e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  37.9 
 
 
217 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 
243 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 
233 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  33.18 
 
 
226 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  33.95 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  32.29 
 
 
225 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  34.27 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 
227 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  38.64 
 
 
213 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.65 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  37.08 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  37.64 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  39.88 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 
215 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 
222 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 
222 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  36.11 
 
 
218 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  36.11 
 
 
218 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  31.28 
 
 
215 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  34.4 
 
 
224 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  35.19 
 
 
215 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.12 
 
 
217 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  40.13 
 
 
230 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  31.28 
 
 
215 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  32.38 
 
 
218 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  34.03 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  31.48 
 
 
219 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.74 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  34.74 
 
 
221 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  33.71 
 
 
216 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  32.2 
 
 
252 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  37.71 
 
 
227 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 
229 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  34.81 
 
 
223 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  30.1 
 
 
245 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  33.71 
 
 
218 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  39.29 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  37.57 
 
 
283 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  39.29 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  39.29 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  39.29 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  39.29 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  39.29 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  30.73 
 
 
230 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 
244 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  38.33 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  32.4 
 
 
220 aa  98.2  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  36.84 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  35.53 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>