More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0340 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  97.72 
 
 		 219 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3763  SNARE associated Golgi protein  84.93 
 
 		 219 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3600  SNARE associated Golgi protein  82.19 
 
 		 220 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4213  SNARE associated Golgi protein  76.26 
 
 		 220 aa  331  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0589  hypothetical protein  75.8 
 
 		 220 aa  328  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0670  SNARE associated Golgi protein  75.8 
 
 		 220 aa  328  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0270  hypothetical protein  75.8 
 
 		 220 aa  328  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  71.23 
 
 		 219 aa  322  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  70.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3419  hypothetical protein  69.86 
 
 		 219 aa  304  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3410  hypothetical protein  71.23 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.998895  normal  0.699642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3345  hypothetical protein  71.23 
 
 		 219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3511  hypothetical protein  71.23 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3336  hypothetical protein  71.23 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3416  hypothetical protein  71.23 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  63.72 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  63.72 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  63.72 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  62.5 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  63.26 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  63.26 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  64.98 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  63.76 
 
 		 232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  63.76 
 
 		 232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  63.76 
 
 		 232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  63.3 
 
 		 224 aa  281  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  63.43 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  64.19 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3514  SNARE associated Golgi protein  62.1 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.443365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  62.33 
 
 		 220 aa  265  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  54.63 
 
 		 216 aa  236  3e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  34.7 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  36.49 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1179  SNARE associated Golgi protein  34.58 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000347  DedA protein  36.02 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0684  inner membrane protein  35.38 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  37.24 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06156  hypothetical protein  37.27 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  35.27 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  35.03 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  34.18 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  36.78 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  34.69 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  34.38 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  34.13 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.36 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.92 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  32.66 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  30.94 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  36.36 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  38.71 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  33.85 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  35.45 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  36.46 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0467  DedA family protein  34.1 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  39.18 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  32.99 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  34.27 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  31.73 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  34.41 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  35.63 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  35.03 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  32.28 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  31.64 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  33.95 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  27.64 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  35.82 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  35.82 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  31.41 
 
 		 279 aa  99.8  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  37.36 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  35.32 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  34.57 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  36.69 
 
 		 253 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  31.79 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  34.09 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>