More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0676 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
206 aa  398  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  57.22 
 
 
194 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  47.62 
 
 
198 aa  147  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  37.77 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  35.08 
 
 
256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  36.9 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  38.42 
 
 
237 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
237 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  39.44 
 
 
363 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  36.67 
 
 
268 aa  111  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.48 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  36.32 
 
 
228 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.41 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  31.89 
 
 
221 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  34.95 
 
 
221 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 
204 aa  104  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  35.39 
 
 
206 aa  104  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  30.22 
 
 
241 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  40.22 
 
 
246 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  34.2 
 
 
221 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  36.08 
 
 
206 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  36.91 
 
 
219 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.72 
 
 
226 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  35.1 
 
 
230 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  34.01 
 
 
214 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  35.78 
 
 
218 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.67 
 
 
217 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  34.48 
 
 
219 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  33.88 
 
 
220 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  31.5 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.98 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  33.01 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.13 
 
 
458 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.55 
 
 
220 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  33.01 
 
 
221 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  33.33 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  32.18 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  32.18 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  32.18 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  34.07 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  32.18 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  32.87 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  33.93 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  36.26 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  32.74 
 
 
202 aa  95.9  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.68 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  39.16 
 
 
207 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  29.57 
 
 
218 aa  95.5  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  31.12 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  31.87 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  36.91 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  32.65 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.65 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  32.65 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  32.65 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  32.65 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  32.65 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  33.16 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  31.79 
 
 
252 aa  94.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  32.92 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  31.31 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  35.33 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  32.99 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  36.07 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.65 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  30.95 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.12 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.08 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  29 
 
 
245 aa  92.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  30.69 
 
 
279 aa  92  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  31.61 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  32.46 
 
 
215 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  33.52 
 
 
219 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
222 aa  92  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  29 
 
 
229 aa  92  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  31.09 
 
 
221 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.71 
 
 
286 aa  91.7  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  35.97 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  32.2 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  33.93 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  39.26 
 
 
260 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  35.97 
 
 
218 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.1 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  34.08 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.1 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.1 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  33.16 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  31.84 
 
 
283 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  33.7 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  34.5 
 
 
235 aa  89.4  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  31.84 
 
 
242 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  32.69 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  38.26 
 
 
234 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>