More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2003 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  57.78 
 
 		 671 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1345    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  88.77 
 
 		 668 aa  1150    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.8 
 
 		 676 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.89 
 
 		 662 aa  335  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  35.6 
 
 		 677 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  32.81 
 
 		 672 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  33.28 
 
 		 672 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  30.78 
 
 		 686 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  33.18 
 
 		 672 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  33.96 
 
 		 672 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  30.03 
 
 		 695 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  33.75 
 
 		 672 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  26.82 
 
 		 682 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  26.66 
 
 		 682 aa  230  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  26.6 
 
 		 678 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.94 
 
 		 684 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  26.81 
 
 		 678 aa  227  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  28.08 
 
 		 684 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.76 
 
 		 664 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  33.83 
 
 		 672 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  32.41 
 
 		 641 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.13 
 
 		 664 aa  176  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.63 
 
 		 702 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.02 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  45.14 
 
 		 239 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.2 
 
 		 664 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.26 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  41.1 
 
 		 218 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  43.95 
 
 		 205 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  42.02 
 
 		 211 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.93 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  26.6 
 
 		 438 aa  125  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  37.3 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  36.22 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.16 
 
 		 438 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 		 255 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  35.11 
 
 		 255 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  35.11 
 
 		 255 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  42.68 
 
 		 208 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  40.74 
 
 		 176 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 255 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  40.36 
 
 		 176 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  28.18 
 
 		 502 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  34.01 
 
 		 255 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  39.76 
 
 		 220 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  39.16 
 
 		 176 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  35.8 
 
 		 255 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  35.8 
 
 		 255 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  35.8 
 
 		 255 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  40.37 
 
 		 176 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 		 241 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  35.8 
 
 		 255 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  35.8 
 
 		 255 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  36.87 
 
 		 232 aa  111  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 256 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  39.41 
 
 		 220 aa  110  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 256 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  35.8 
 
 		 254 aa  110  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  35.53 
 
 		 255 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  36.81 
 
 		 254 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  26.85 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  37.16 
 
 		 176 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  38.71 
 
 		 176 aa  107  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  38.27 
 
 		 176 aa  107  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  39.51 
 
 		 176 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.85 
 
 		 438 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.26 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.28 
 
 		 438 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  26.32 
 
 		 438 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  33.97 
 
 		 220 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  40.36 
 
 		 220 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  33.17 
 
 		 216 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  99.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.89 
 
 		 217 aa  98.2  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  32.51 
 
 		 220 aa  96.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 		 438 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.15 
 
 		 521 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  37.42 
 
 		 176 aa  95.1  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  37.42 
 
 		 176 aa  95.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  37.42 
 
 		 176 aa  95.1  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  30.93 
 
 		 219 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.93 
 
 		 219 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.62 
 
 		 219 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  30.93 
 
 		 219 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  30.93 
 
 		 219 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  30.93 
 
 		 219 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  30.93 
 
 		 219 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.3 
 
 		 224 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  32.43 
 
 		 219 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.93 
 
 		 219 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.93 
 
 		 219 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>