More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4725 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 325 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 325 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  79.68 
 
 		 326 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  41.98 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  40.45 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  39.42 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  42.07 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  39.68 
 
 		 349 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  39.87 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  39.38 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  39.32 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  38.7 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  39.06 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  39.37 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  39.06 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  41.93 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  36.81 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  41.81 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  38.22 
 
 		 330 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  43.35 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  39.05 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  39.38 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  38.85 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  40 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  38.54 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  38.54 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  38.54 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  38.54 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  38.54 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  38.54 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  38.1 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  37.34 
 
 		 338 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  37.5 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  41.99 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  36.56 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  36.56 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  36.56 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  36.56 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  36.56 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  36.56 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  36.56 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  35.6 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  37.38 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  37.62 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  37.54 
 
 		 332 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  40.97 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  38.57 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  39.8 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  35.36 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  37.69 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.85 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.18 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.25 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  29.09 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  27.72 
 
 		 213 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  30.65 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  24.88 
 
 		 199 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  24.15 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  29.29 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  29.56 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  29.29 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 213 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 205 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  26.16 
 
 		 201 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  30.93 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  24.1 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  31.13 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  35.2 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  25.77 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  31.48 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  29.34 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  23.76 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.77 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  25.27 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  30.56 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  30.5 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  30.99 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  31.21 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  31.08 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  24.07 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  24.85 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>