More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6745 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 189 aa  363  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  86.24 
 
 		 189 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  46.99 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  43.11 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  37.64 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  36.32 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  37.82 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  36.97 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.97 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  37.82 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  37.82 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  36.97 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  36.97 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  36.97 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  36.97 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  37.82 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  39.02 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  32.24 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  36.97 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  36.97 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  32.6 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  34.62 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 220 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  35.71 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  35.71 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  35.06 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  34.55 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  35.37 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  35.62 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  30.46 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  33.91 
 
 		 185 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  32.72 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  34.42 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  33.94 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  35.66 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  33.57 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  32.7 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  35.77 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  31.14 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  35.04 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  35.04 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  33.73 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  33.13 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  30.72 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  34.03 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  27.16 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  24.32 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  34.31 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  32.81 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  29.34 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  29.34 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  28.17 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  29.27 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  28.27 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  25.57 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.39 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  27.04 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  27.75 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  28.07 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  30.88 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  29.84 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  29.84 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  31.62 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  31.62 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  27.97 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  31.62 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  38.97 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  26.01 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.14 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  26.94 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  30.54 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  28.8 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  27.27 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  29.23 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  23.7 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  31.5 
 
 		 321 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  24 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  27.67 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  30.94 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  32.91 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  26.11 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  22.58 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  22.78 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  30.77 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 244 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  29.79 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  24.54 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  24.82 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  28.12 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>