226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1332 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  100 
 
 
185 aa  357  6e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  55.08 
 
 
189 aa  204  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  49.2 
 
 
189 aa  190  8e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  48.66 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  48.13 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  47.85 
 
 
190 aa  179  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  45.45 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  43.24 
 
 
185 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  41.62 
 
 
185 aa  150  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  41.62 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  35.33 
 
 
197 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  36.7 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  34.41 
 
 
201 aa  115  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  36.17 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  37.33 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  36.17 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  36.17 
 
 
198 aa  111  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  38.55 
 
 
229 aa  106  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 
179 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  27.11 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  33.12 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  31.4 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  32.07 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  30.9 
 
 
212 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  29.94 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  29.93 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  29.75 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  30.38 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  30.86 
 
 
220 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  29.78 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  27.72 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  30.38 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  22.04 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  30.14 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.01 
 
 
215 aa  61.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  29.03 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  25.98 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  29.03 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  27.71 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.81 
 
 
438 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  25.25 
 
 
198 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  25.64 
 
 
184 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  23.81 
 
 
437 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  24.6 
 
 
437 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  29.37 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  26.97 
 
 
241 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.57 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 
189 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  26.12 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  26.12 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  26.12 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  22.52 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  23.14 
 
 
222 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  23.97 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
664 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  25.57 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  22.22 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  26.25 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  29.55 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.49 
 
 
286 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  25.77 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  27.04 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  23.85 
 
 
194 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  20.97 
 
 
189 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  20.97 
 
 
189 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  20.97 
 
 
189 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  20.97 
 
 
189 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.64 
 
 
664 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  20.97 
 
 
189 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  24.74 
 
 
268 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  20.5 
 
 
228 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  23.62 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  34.31 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 
279 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  25.57 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  25.57 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  23.02 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  21.43 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  21.43 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  21.43 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.54 
 
 
469 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  21.43 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  21.43 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  21.43 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  25.58 
 
 
438 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  25.45 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  21.43 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  23.97 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  19.23 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  23.08 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  25 
 
 
235 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  22.56 
 
 
218 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  21.47 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  23.31 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.06 
 
 
206 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  23.03 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  23.03 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.35 
 
 
668 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>