More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7566 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  64.68 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  60.38 
 
 		 205 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  61.61 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  69.66 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.79 
 
 		 671 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.24 
 
 		 676 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.56 
 
 		 668 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  41.1 
 
 		 681 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  42.07 
 
 		 686 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.74 
 
 		 664 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.41 
 
 		 662 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  36.81 
 
 		 682 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  36.81 
 
 		 682 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  37.25 
 
 		 641 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  31.29 
 
 		 678 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  31.29 
 
 		 678 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.64 
 
 		 483 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  31.14 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  37.65 
 
 		 438 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.35 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  32.84 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.42 
 
 		 438 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.42 
 
 		 664 aa  99  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  34.81 
 
 		 437 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  31.84 
 
 		 677 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  35.44 
 
 		 437 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  32.34 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.74 
 
 		 469 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  36.2 
 
 		 176 aa  95.9  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  32.72 
 
 		 695 aa  95.1  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.35 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  34.84 
 
 		 176 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  31.34 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  31.34 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  34.66 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  31.34 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  31.34 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  31.34 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 438 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  31.05 
 
 		 255 aa  91.7  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  35.06 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  32.1 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  31.78 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  35.06 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  30.41 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  38.75 
 
 		 174 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  36.59 
 
 		 672 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  31.48 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  31.93 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  32.24 
 
 		 176 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  33.33 
 
 		 438 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.12 
 
 		 684 aa  85.5  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  35.58 
 
 		 672 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  35.77 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.66 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.36 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.71 
 
 		 664 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  29.01 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  28.02 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  35.54 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.72 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  35.54 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  35.54 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  31.76 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  31.76 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  33.77 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  31.76 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  34.97 
 
 		 672 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  32.1 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  31.48 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  33.77 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  35.93 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  30.06 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  27.4 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  32.48 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.04 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  36.59 
 
 		 672 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  26.79 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28.92 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.1 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  35.98 
 
 		 672 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  35.9 
 
 		 672 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>