More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3501 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  79.32 
 
 		 672 aa  974    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  87.2 
 
 		 672 aa  1017    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  85.86 
 
 		 672 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  97.32 
 
 		 672 aa  1166    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  85.71 
 
 		 672 aa  1035    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  100 
 
 		 672 aa  1297    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  49.92 
 
 		 677 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.42 
 
 		 662 aa  303  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.69 
 
 		 668 aa  296  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  33.7 
 
 		 681 aa  293  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.55 
 
 		 676 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.79 
 
 		 671 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  31.13 
 
 		 686 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  29.86 
 
 		 684 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.7 
 
 		 684 aa  191  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  28.89 
 
 		 695 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.44 
 
 		 664 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  29.48 
 
 		 641 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  26.26 
 
 		 678 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  25.94 
 
 		 678 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.82 
 
 		 664 aa  151  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  24.92 
 
 		 682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  25.35 
 
 		 682 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.25 
 
 		 664 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.11 
 
 		 702 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.03 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  37.2 
 
 		 239 aa  108  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  44.36 
 
 		 241 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  35.37 
 
 		 205 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  36.27 
 
 		 213 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  30.27 
 
 		 255 aa  99.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  30.27 
 
 		 255 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  30.27 
 
 		 255 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  36.26 
 
 		 211 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  38.71 
 
 		 220 aa  98.2  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 255 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  37.41 
 
 		 232 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  37.8 
 
 		 208 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  34.97 
 
 		 218 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  38.06 
 
 		 220 aa  95.1  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  34 
 
 		 255 aa  94.7  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 		 256 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  26.79 
 
 		 502 aa  91.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  32.57 
 
 		 256 aa  91.3  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  36.65 
 
 		 173 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.25 
 
 		 457 aa  89.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.59 
 
 		 256 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  24.35 
 
 		 438 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  30.39 
 
 		 215 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  30.39 
 
 		 215 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  38.62 
 
 		 176 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  32.79 
 
 		 216 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  36.77 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  34.39 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.23 
 
 		 438 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  35.19 
 
 		 176 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.07 
 
 		 219 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  31.21 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  31.21 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  31.21 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  31.21 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  31.21 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  31.46 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  31.74 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  31.46 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  33.71 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.53 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  34.48 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.65 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  30.06 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.81 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  38.97 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  30.85 
 
 		 437 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.06 
 
 		 219 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  29.84 
 
 		 255 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 217 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  30.43 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  30.57 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.33 
 
 		 219 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.48 
 
 		 219 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  31.36 
 
 		 439 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  30.18 
 
 		 437 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.48 
 
 		 219 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.48 
 
 		 219 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>