More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02300 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  100 
 
 
695 aa  1362    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  69.85 
 
 
684 aa  892    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  71.56 
 
 
664 aa  855    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  70.15 
 
 
684 aa  899    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.81 
 
 
676 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.08 
 
 
668 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  29.52 
 
 
681 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  31.83 
 
 
677 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  30.48 
 
 
641 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  28.51 
 
 
682 aa  213  9e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  28.51 
 
 
682 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.68 
 
 
662 aa  208  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  26.28 
 
 
678 aa  194  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  25.77 
 
 
678 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.95 
 
 
671 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.93 
 
 
664 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  28.85 
 
 
672 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  27.55 
 
 
672 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  28.3 
 
 
672 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.91 
 
 
483 aa  145  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.4 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.66 
 
 
664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  28.5 
 
 
672 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  26.54 
 
 
686 aa  134  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  28.03 
 
 
672 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  35.71 
 
 
232 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.12 
 
 
438 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  33.17 
 
 
437 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  33.01 
 
 
437 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.31 
 
 
438 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  27.45 
 
 
672 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  26.4 
 
 
438 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  26.84 
 
 
438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  33.9 
 
 
220 aa  109  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  34.08 
 
 
220 aa  107  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.54 
 
 
438 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.64 
 
 
438 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  35.12 
 
 
439 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.43 
 
 
438 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 
256 aa  101  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  27.47 
 
 
255 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  26.27 
 
 
438 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  34.94 
 
 
176 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  27.47 
 
 
255 aa  99.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  27.47 
 
 
255 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  31.14 
 
 
255 aa  97.4  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.11 
 
 
254 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
176 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  29.94 
 
 
255 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  27.09 
 
 
256 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  29.94 
 
 
255 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  30.11 
 
 
254 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  29.94 
 
 
255 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  29.94 
 
 
255 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  29.94 
 
 
255 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
220 aa  95.1  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  32.72 
 
 
218 aa  95.1  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  33.12 
 
 
176 aa  94.7  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  37.65 
 
 
173 aa  94  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  94  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.08 
 
 
256 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  37.06 
 
 
208 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  20.31 
 
 
702 aa  93.6  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  33.77 
 
 
176 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 
205 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 
255 aa  92.4  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  33.12 
 
 
176 aa  91.3  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  91.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  26.6 
 
 
255 aa  90.1  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  31.5 
 
 
211 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  29.94 
 
 
211 aa  87.8  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  33.97 
 
 
176 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  34.76 
 
 
173 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 
241 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  34.38 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  35.62 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  34.38 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  35.85 
 
 
176 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  35.85 
 
 
173 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  25.65 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  27.37 
 
 
211 aa  75.5  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  30.87 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  25.81 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  36.88 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.59 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  29.59 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.59 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.59 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.59 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  35.17 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>