More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1019 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  100 
 
 
502 aa  986    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.65 
 
 
702 aa  147  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  28.01 
 
 
681 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.71 
 
 
676 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  26.26 
 
 
678 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  27.47 
 
 
678 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.44 
 
 
668 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.82 
 
 
671 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.65 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.37 
 
 
664 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.38 
 
 
438 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  28.83 
 
 
677 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.21 
 
 
457 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.32 
 
 
483 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  25.84 
 
 
684 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  25.27 
 
 
695 aa  93.6  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  36.84 
 
 
682 aa  93.2  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  36.84 
 
 
682 aa  93.2  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.43 
 
 
469 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  31.6 
 
 
256 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.19 
 
 
256 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.23 
 
 
684 aa  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  36.3 
 
 
206 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.89 
 
 
521 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
205 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  28.21 
 
 
438 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  36.3 
 
 
641 aa  86.7  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  28.57 
 
 
672 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.6 
 
 
331 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  29.59 
 
 
232 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.81 
 
 
271 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.22 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.02 
 
 
664 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  36.3 
 
 
202 aa  85.1  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.61 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.86 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  24.88 
 
 
686 aa  83.2  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  32.7 
 
 
223 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  32.48 
 
 
218 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.15 
 
 
331 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.2 
 
 
249 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.28 
 
 
254 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  31.28 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  31.28 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.57 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  31.28 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  31.28 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  31.61 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  31.28 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  32.47 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  34.06 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  30.77 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  28.16 
 
 
672 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  33.95 
 
 
241 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  31.82 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  31.25 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
271 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.4 
 
 
664 aa  77  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  33.09 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 
200 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  25.88 
 
 
672 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  33.77 
 
 
208 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  31.64 
 
 
211 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.69 
 
 
198 aa  76.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  29.78 
 
 
212 aa  75.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  29.71 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  29.71 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  29.93 
 
 
239 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.29 
 
 
220 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  32.35 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.94 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.69 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.1 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.1 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  39.23 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.1 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.1 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.32 
 
 
252 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  29.5 
 
 
223 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  29.49 
 
 
211 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  33.11 
 
 
213 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 
223 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0799  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.1 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  28.64 
 
 
221 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>