More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2315 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  341  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  85.23 
 
 		 176 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  75 
 
 		 176 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  70.45 
 
 		 176 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  71.02 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  68.75 
 
 		 176 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  71.02 
 
 		 176 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  57.42 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  58.44 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  58.44 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  58.44 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  45.96 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  45.39 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  47.83 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  47.83 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  47.83 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  45.28 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  38.32 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  34.66 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  34.09 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  37.72 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  46.5 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  40.74 
 
 		 220 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.24 
 
 		 671 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  47.53 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  38.89 
 
 		 232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  46.15 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  33.52 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  38.79 
 
 		 678 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  38.79 
 
 		 678 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.86 
 
 		 676 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.24 
 
 		 664 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.51 
 
 		 668 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  39.35 
 
 		 255 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  36.77 
 
 		 255 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  38.27 
 
 		 681 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  39.33 
 
 		 686 aa  104  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  38.99 
 
 		 241 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  34.19 
 
 		 255 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.18 
 
 		 664 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  34.01 
 
 		 254 aa  101  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  38.24 
 
 		 256 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  33.33 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  37.14 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  35.46 
 
 		 255 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  35.46 
 
 		 255 aa  98.6  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  35.46 
 
 		 255 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  35.22 
 
 		 641 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  31.76 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.12 
 
 		 256 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  33.12 
 
 		 695 aa  94.4  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.38 
 
 		 469 aa  94.4  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.03 
 
 		 662 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 682 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  35.62 
 
 		 682 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.11 
 
 		 684 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  33.11 
 
 		 684 aa  89  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  36.99 
 
 		 677 aa  87.8  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.93 
 
 		 483 aa  87.8  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.1 
 
 		 438 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  31.9 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.49 
 
 		 664 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  29.01 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  32.72 
 
 		 438 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.1 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  30.34 
 
 		 437 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  31.45 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  30.34 
 
 		 437 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  32.94 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  31.71 
 
 		 672 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  30.25 
 
 		 672 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  33.08 
 
 		 438 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  31.03 
 
 		 438 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0383  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.53 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  30.97 
 
 		 439 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0340  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1826  DedA family protein  31.62 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.753074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.01 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  30.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  30.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  30.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  30.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  30.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.72 
 
 		 438 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>