More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3105 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 686 aa  1321    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.21 
 
 		 676 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.93 
 
 		 662 aa  292  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  31.22 
 
 		 681 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.73 
 
 		 668 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  32.95 
 
 		 677 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.84 
 
 		 671 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  32.2 
 
 		 672 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  32.81 
 
 		 672 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  31.57 
 
 		 672 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  33.44 
 
 		 672 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  31.22 
 
 		 672 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  33.28 
 
 		 672 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  24.92 
 
 		 678 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  24.69 
 
 		 678 aa  179  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  29.82 
 
 		 641 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.73 
 
 		 684 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  25.42 
 
 		 684 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  25.29 
 
 		 682 aa  159  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  25.16 
 
 		 682 aa  157  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  26.57 
 
 		 695 aa  144  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.64 
 
 		 664 aa  140  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  42.01 
 
 		 205 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  39.9 
 
 		 211 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  38.54 
 
 		 218 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  42 
 
 		 239 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.85 
 
 		 664 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.48 
 
 		 702 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  42.68 
 
 		 208 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  37.13 
 
 		 176 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  38.22 
 
 		 176 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.24 
 
 		 664 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  39.33 
 
 		 176 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  40.79 
 
 		 176 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  39.51 
 
 		 174 aa  100  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  35.9 
 
 		 176 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.19 
 
 		 469 aa  99.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  35.81 
 
 		 176 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  24.5 
 
 		 438 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  27.07 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.12 
 
 		 483 aa  95.5  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  35.44 
 
 		 176 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0269  DedA family protein  38.93 
 
 		 176 aa  94.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.867407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3947  hypothetical protein  38.93 
 
 		 176 aa  94.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3643  hypothetical protein  38.93 
 
 		 176 aa  94.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  40.3 
 
 		 173 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  38.17 
 
 		 173 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0188  hypothetical protein  35.93 
 
 		 179 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0587064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  36.08 
 
 		 255 aa  91.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1821  uncharacterized membrane-associated protein  35.33 
 
 		 179 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.274709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2791  hypothetical protein  40.46 
 
 		 173 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2669  hypothetical protein  37.58 
 
 		 173 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.618552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  35.81 
 
 		 176 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2896  hypothetical protein  37.58 
 
 		 173 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0774242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.22 
 
 		 438 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  32.43 
 
 		 232 aa  89.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  37.13 
 
 		 179 aa  88.6  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  33.72 
 
 		 212 aa  88.6  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  29.96 
 
 		 221 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  29.21 
 
 		 255 aa  88.2  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  32.97 
 
 		 254 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  32.97 
 
 		 254 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 254 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  32.97 
 
 		 254 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  30.69 
 
 		 254 aa  88.2  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  32.97 
 
 		 254 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  31.52 
 
 		 245 aa  87.8  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.43 
 
 		 254 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  32.43 
 
 		 254 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  32.43 
 
 		 254 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 		 218 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 		 224 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.05 
 
 		 213 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0937  hypothetical protein  35.9 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  29.2 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  29.2 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.59 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  34.21 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  34.21 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  29.33 
 
 		 255 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  27.89 
 
 		 252 aa  83.2  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  32.56 
 
 		 219 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.82 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1146  SNARE associated Golgi protein  40.41 
 
 		 173 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  26.29 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  31.41 
 
 		 255 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  31.41 
 
 		 255 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  31.41 
 
 		 255 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 		 241 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  31.41 
 
 		 255 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  31.41 
 
 		 255 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  30.36 
 
 		 237 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 216 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.94 
 
 		 218 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  34.42 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.58 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>