More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1883 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
702 aa  1410    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.4 
 
 
331 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.28 
 
 
676 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.08 
 
 
331 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.57 
 
 
331 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  26.63 
 
 
681 aa  165  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.04 
 
 
457 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.28 
 
 
668 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1429  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.62 
 
 
293 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  27.43 
 
 
502 aa  134  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  21.77 
 
 
671 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.19 
 
 
251 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  24.66 
 
 
677 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.09 
 
 
662 aa  128  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  25.46 
 
 
678 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  26.77 
 
 
678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  27.04 
 
 
682 aa  115  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  27.04 
 
 
682 aa  115  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  26.82 
 
 
686 aa  108  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.5 
 
 
320 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  38.31 
 
 
217 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.52 
 
 
211 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2417  PAP2 family protein  33.18 
 
 
213 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2126  phosphoesterase PA-phosphatase related  36 
 
 
213 aa  101  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807737  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.18 
 
 
201 aa  99  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  34.29 
 
 
213 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2088  phosphatidylglycerophosphatase B  34.29 
 
 
213 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0563174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
214 aa  97.8  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  35.56 
 
 
200 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.49 
 
 
206 aa  97.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2154  PAP2 family protein  33.71 
 
 
213 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2092  phosphatidylglycerophosphatase B  33.71 
 
 
213 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  32.7 
 
 
213 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2309  PAP2 family protein  33.71 
 
 
213 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2335  PAP2 family protein  33.71 
 
 
213 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  36.91 
 
 
237 aa  95.5  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  33.76 
 
 
211 aa  95.5  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  34 
 
 
223 aa  94.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
664 aa  94  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.52 
 
 
483 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  24.25 
 
 
684 aa  93.2  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  22.46 
 
 
672 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 
222 aa  91.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 
216 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
216 aa  90.9  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.03 
 
 
684 aa  90.1  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  32.48 
 
 
219 aa  90.1  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  20.31 
 
 
695 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  31.76 
 
 
232 aa  89.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.41 
 
 
252 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  35.06 
 
 
218 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 
201 aa  88.2  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  31.41 
 
 
224 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.58 
 
 
241 aa  88.2  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  28.41 
 
 
268 aa  87.8  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  21.29 
 
 
672 aa  87.4  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 
230 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.73 
 
 
360 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1827  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.68 
 
 
282 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.31058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  33.11 
 
 
220 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28.93 
 
 
220 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.38 
 
 
271 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  33.75 
 
 
237 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  33.75 
 
 
237 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  32.67 
 
 
204 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 
202 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  31.54 
 
 
213 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.13 
 
 
220 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  31.13 
 
 
221 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2181  hypothetical protein  29.24 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0466384  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  20.79 
 
 
672 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
215 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  31.47 
 
 
211 aa  85.1  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  31.13 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  32.65 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  31.13 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  31.13 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.86 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  31.13 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.45 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  21.25 
 
 
672 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.44 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.33 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.79 
 
 
220 aa  84  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 
229 aa  83.2  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.91 
 
 
238 aa  84  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.33 
 
 
267 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
221 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.59 
 
 
256 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 
206 aa  83.2  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  33.33 
 
 
256 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  31.48 
 
 
214 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.12 
 
 
255 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.67 
 
 
267 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  31.48 
 
 
214 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.78 
 
 
255 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.03 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.16 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>