More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4038 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 662 aa  1282    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.4 
 
 		 676 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  40.1 
 
 		 677 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.7 
 
 		 671 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  37.48 
 
 		 681 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.93 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3597  DedA family membrane protein  38.21 
 
 		 672 aa  336  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.673298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5092  SNARE associated Golgi protein  39.46 
 
 		 672 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5332  DedA family membrane protein  38.2 
 
 		 672 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.239608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  34.89 
 
 		 686 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3923  SNARE associated Golgi protein  38.99 
 
 		 672 aa  312  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3501  DedA family membrane protein  38.2 
 
 		 672 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0300275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2518  DedA family membrane protein  38.76 
 
 		 672 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  30.68 
 
 		 695 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  30.59 
 
 		 684 aa  243  7e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 682 aa  243  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0212  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.59 
 
 		 684 aa  243  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  31.86 
 
 		 682 aa  242  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3299  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.51 
 
 		 664 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  27 
 
 		 678 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  27.16 
 
 		 678 aa  233  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  32.27 
 
 		 641 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.29 
 
 		 664 aa  198  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.13 
 
 		 664 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.68 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.1 
 
 		 483 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.62 
 
 		 702 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  29.56 
 
 		 438 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  31.03 
 
 		 438 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.82 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.8 
 
 		 438 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.58 
 
 		 438 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  31.19 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  40.83 
 
 		 239 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2592  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.54 
 
 		 371 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  35.92 
 
 		 218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  31.47 
 
 		 502 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 		 205 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  39.32 
 
 		 211 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0540  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  39.24 
 
 		 176 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.94 
 
 		 521 aa  115  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  39.51 
 
 		 176 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00067  conserved inner membrane protein  35.26 
 
 		 254 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00066  hypothetical protein  35.26 
 
 		 254 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3592  SNARE associated Golgi protein  34.74 
 
 		 254 aa  112  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.305226  hitchhiker  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0069  hypothetical protein  34.74 
 
 		 254 aa  112  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0067  hypothetical protein  34.74 
 
 		 254 aa  112  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0057  hypothetical protein  34.74 
 
 		 254 aa  112  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0069  hypothetical protein  34.74 
 
 		 254 aa  112  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820004  normal  0.658906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  39.51 
 
 		 176 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  39.49 
 
 		 232 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0070  hypothetical protein  34.74 
 
 		 254 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3534  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.21 
 
 		 254 aa  111  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  33.99 
 
 		 255 aa  111  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  41.18 
 
 		 220 aa  110  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  40.96 
 
 		 220 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  32.8 
 
 		 255 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  32.8 
 
 		 255 aa  108  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 		 255 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0732  SNARE associated Golgi protein  33.51 
 
 		 256 aa  107  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0112  inner membrane protein YabI  32.76 
 
 		 255 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.372252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  33.94 
 
 		 176 aa  107  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0116  inner membrane protein YabI  32.76 
 
 		 255 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0116  inner membrane protein YabI  32.76 
 
 		 255 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0531924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0109  inner membrane protein YabI  32.76 
 
 		 255 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0111  hypothetical protein  32.76 
 
 		 255 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.277229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0246  DedA family protein  37.42 
 
 		 176 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  38.69 
 
 		 176 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  35.03 
 
 		 176 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.93 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  45 
 
 		 200 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3626  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 256 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  37.2 
 
 		 211 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0615  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 255 aa  97.4  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0306  hypothetical protein  35.29 
 
 		 173 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  39.16 
 
 		 220 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.42 
 
 		 249 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3815  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.03 
 
 		 256 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  30.37 
 
 		 255 aa  94.7  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6468  hypothetical protein  33.82 
 
 		 173 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.379701  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.86 
 
 		 331 aa  91.3  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1430  hypothetical protein  45.19 
 
 		 173 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.87219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.17 
 
 		 267 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  31.35 
 
 		 237 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3203  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 174 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.473398  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1058  hypothetical protein  45.19 
 
 		 173 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.76 
 
 		 267 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.36 
 
 		 249 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.35 
 
 		 438 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  38.13 
 
 		 241 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.07 
 
 		 252 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.63 
 
 		 250 aa  87  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2434  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.11 
 
 		 240 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.18 
 
 		 267 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  36.87 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.35 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.32 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.656269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>