More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3250 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  99.63 
 
 
267 aa  523  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  94.38 
 
 
267 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  74.6 
 
 
252 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.93 
 
 
249 aa  324  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.23 
 
 
249 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  55.09 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  53.85 
 
 
256 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.89 
 
 
255 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.54 
 
 
255 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.25 
 
 
256 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.07 
 
 
255 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1755  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.85 
 
 
256 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.54 
 
 
257 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.16 
 
 
244 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.6 
 
 
249 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.63 
 
 
251 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.96 
 
 
241 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.7 
 
 
241 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.5 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.01 
 
 
248 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  43.3 
 
 
227 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.28 
 
 
242 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0197  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.8 
 
 
242 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0713  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.79 
 
 
254 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.065408  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.2 
 
 
254 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03667  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.57 
 
 
230 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.38 
 
 
238 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  43.28 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.49 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.63 
 
 
320 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.59 
 
 
360 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.75 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.03 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.4 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.22 
 
 
211 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.18 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  37.14 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.08 
 
 
676 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2226  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.71 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.33 
 
 
702 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2290  PAP2 family protein  42.45 
 
 
138 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  37.8 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2126  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.01 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  35.43 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2154  PAP2 family protein  35.43 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2092  phosphatidylglycerophosphatase B  35.43 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2088  phosphatidylglycerophosphatase B  35.43 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0563174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2309  PAP2 family protein  35.43 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2335  PAP2 family protein  35.43 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0979  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  33.81 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.626703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2417  PAP2 family protein  35.43 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.14 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2434  phosphoesterase PA-phosphatase related  35 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2814  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.4 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000029245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1245  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.28 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.31 
 
 
662 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.88 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  40.32 
 
 
438 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.18 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0831  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.62 
 
 
199 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.88 
 
 
224 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.07 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.46 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.25 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.85 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.7 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0429  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.26 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.402808  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.1 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2181  hypothetical protein  35.06 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0466384  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4399  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1353  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.36 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.44 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  38.1 
 
 
437 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.3 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3543  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  31.17 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  35.12 
 
 
203 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  37.14 
 
 
437 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2592  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.58 
 
 
371 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2541  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  38.89 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1164  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.87 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.5 
 
 
219 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.5 
 
 
219 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.5 
 
 
219 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  29.26 
 
 
204 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  28.64 
 
 
243 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  40 
 
 
215 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1203  PAP2 family protein  39.29 
 
 
205 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2061  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1181  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  42.86 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1183  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  42.86 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1439  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.59 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437325  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1301  PAP2 family protein  39.29 
 
 
205 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.22 
 
 
521 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>