More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4992 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 200 aa  373  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  54.4 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  51.79 
 
 		 256 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  52.46 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  55.1 
 
 		 239 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  47.2 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  44.24 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  42.05 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  42.7 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  34.93 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.88 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.19 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.62 
 
 		 457 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  43.79 
 
 		 245 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.86 
 
 		 231 aa  98.6  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  41.67 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  26.83 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 223 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.56 
 
 		 702 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.83 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  39.9 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  34.27 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  39.9 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  38.04 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  38.81 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  34.21 
 
 		 237 aa  95.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  33.72 
 
 		 471 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.89 
 
 		 237 aa  94.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  35.03 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  42.47 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  37.62 
 
 		 355 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.78 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.71 
 
 		 664 aa  90.9  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.14 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.78 
 
 		 363 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.37 
 
 		 248 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.5 
 
 		 521 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  29.59 
 
 		 256 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  34.43 
 
 		 681 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.58 
 
 		 671 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  36.18 
 
 		 268 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.3 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  25.38 
 
 		 249 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  38.92 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  29.52 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.43 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  30.57 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  29.19 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.04 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  29.09 
 
 		 259 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  39.66 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 		 212 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.38 
 
 		 662 aa  84.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  29.51 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  26.15 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.79 
 
 		 668 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  29.09 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  38.51 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  38.51 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  38.51 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.91 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  27.53 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  33.76 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  30.41 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  29.19 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  33.85 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 473 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.76 
 
 		 438 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  30.11 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  34 
 
 		 437 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  27.91 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  33.15 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  34 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.43 
 
 		 676 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  36.88 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.67 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  27.54 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.47 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  33.95 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  28.66 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  26.49 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  43.9 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  30.41 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6733  membrane protein, DedA family  35.33 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  27.34 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.85 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>