More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1909 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.18 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02660  hypothetical protein  32.48 
 
 		 431 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.61 
 
 		 676 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  29.78 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.84 
 
 		 668 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 664 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  32.53 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  27.27 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.51 
 
 		 664 aa  72.8  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  34.18 
 
 		 678 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  34.18 
 
 		 678 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  35.97 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0339  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  30.63 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  31.69 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  35 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.63 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.88 
 
 		 702 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  31.01 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  28.08 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  29.49 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  29.88 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.55 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  31.55 
 
 		 176 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.76 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  31.1 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  26.97 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0055  DedA family protein  28.9 
 
 		 641 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.381333  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.82 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  26.45 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  29.05 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.14 
 
 		 521 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  27.1 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  26.38 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  29.69 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  25.77 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7566  hypothetical protein  29.17 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  30.38 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.17 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.74 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  31.1 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2315  hypothetical protein  29.48 
 
 		 176 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  25.96 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  30.23 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  30.65 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  27.97 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  26.45 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.93 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2485  DedA family integral membrane protein  32.14 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  32.63 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  32.55 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  24.76 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  29.41 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  27.74 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  26.98 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1652  hypothetical protein  27.75 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.276221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  26.39 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  27.16 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  26.4 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  29.87 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  25.58 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1408  membrane protein  30.72 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  28.98 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.2 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  27.64 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  23.87 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  30.13 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  28.64 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  27.41 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  27.64 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  25.36 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  27.92 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  27.27 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.5 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.81 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  30.23 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  24.76 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  23.78 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>