212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02660 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02660  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  877    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1408  membrane protein  56.77 
 
 		 192 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0339  SNARE associated Golgi protein  35.1 
 
 		 169 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.48 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0858  hypothetical protein  33.09 
 
 		 284 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6947  hypothetical protein  29.63 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5629  hypothetical protein  38.2 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.55 
 
 		 702 aa  67  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2610  hypothetical protein  30.13 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5217  hypothetical protein  38.2 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  32.87 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  27.96 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  26.46 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  26.59 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 224 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30470  hypothetical protein  30.46 
 
 		 568 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 219 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 		 224 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.2 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  25.91 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.02 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  24.58 
 
 		 204 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.53 
 
 		 204 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  25.29 
 
 		 204 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  25.52 
 
 		 220 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  23.83 
 
 		 204 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  28.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  28.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  29.01 
 
 		 214 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  27.07 
 
 		 204 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  27.07 
 
 		 204 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  27.07 
 
 		 204 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  28.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  27.07 
 
 		 204 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  27.38 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  28.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.02 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  26.46 
 
 		 200 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  28.31 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.16 
 
 		 217 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  27.07 
 
 		 204 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 216 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  28.26 
 
 		 259 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  26.79 
 
 		 219 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  29.41 
 
 		 232 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  27.38 
 
 		 220 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  53.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  27.21 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  26.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  29.5 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.62 
 
 		 664 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  28.14 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  28.46 
 
 		 213 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  27.21 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  26.47 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  27.21 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.48 
 
 		 212 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  28.12 
 
 		 220 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.37 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  27.65 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.63 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.79 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5807  SNARE associated Golgi protein  26.21 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468515  normal  0.433949 
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  24.83 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.79 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  29.55 
 
 		 198 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.32 
 
 		 202 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  26.74 
 
 		 219 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.03 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  26.81 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  30.63 
 
 		 203 aa  51.2  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 		 222 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  26.24 
 
 		 213 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 		 230 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3199  hypothetical protein  34.78 
 
 		 453 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  27.18 
 
 		 211 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  25.74 
 
 		 221 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  28.36 
 
 		 252 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.33 
 
 		 215 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  31.08 
 
 		 205 aa  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 		 221 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.01 
 
 		 521 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  49.7  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.06 
 
 		 203 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  26.77 
 
 		 218 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1720  DedA family protein  29.2 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  26.72 
 
 		 214 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  26.77 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  28.47 
 
 		 214 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.18 
 
 		 668 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>