More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2070 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 
215 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  46.19 
 
 
213 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  49.17 
 
 
199 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  46.19 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  45.19 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  45.19 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 
214 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  45.21 
 
 
213 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  42 
 
 
215 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  45.5 
 
 
205 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  45.81 
 
 
355 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 
217 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  44.21 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  46.3 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.33 
 
 
457 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  43.33 
 
 
209 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  42.01 
 
 
208 aa  122  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  45.16 
 
 
212 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  45.16 
 
 
212 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38.55 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  42 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.21 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.15 
 
 
211 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  35.6 
 
 
211 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  34.83 
 
 
220 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  34.76 
 
 
220 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  38.73 
 
 
206 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  34.98 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  36.73 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  36.81 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  36.31 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.11 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  40.52 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  34.48 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  40.52 
 
 
172 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  35.75 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  41.29 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  37.63 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  30.69 
 
 
241 aa  94  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.48 
 
 
521 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  37.74 
 
 
262 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  32.91 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  37.75 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  32.04 
 
 
221 aa  92  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.72 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32.62 
 
 
206 aa  91.7  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
279 aa  91.3  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  37.25 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  31.19 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  35.12 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.01 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31.87 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  36 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  32.54 
 
 
245 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  33.33 
 
 
214 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  30.56 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.17 
 
 
248 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  36.09 
 
 
237 aa  86.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  34.72 
 
 
218 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  34.72 
 
 
218 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 
172 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  29.3 
 
 
206 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  33.17 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  34.65 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.57 
 
 
203 aa  85.9  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  34.33 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  32.74 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.32 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  33.54 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  31.96 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.96 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.06 
 
 
221 aa  85.1  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  31.96 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.03 
 
 
218 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  37.12 
 
 
246 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  34.71 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  32.31 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  31.05 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  29.26 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  41.83 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.96 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  39.74 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  32.26 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.12 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>