49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0339 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0339  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 169 aa  332  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02660  hypothetical protein  35.1 
 
 		 431 aa  85.1  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1408  membrane protein  36.42 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.03 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.88 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.56 
 
 		 668 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  30.91 
 
 		 437 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 		 521 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  29.45 
 
 		 437 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.32 
 
 		 664 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  28.67 
 
 		 681 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2826  hypothetical protein  26.49 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0614452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  27.73 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  26.81 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2766  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.44 
 
 		 702 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  28.67 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  26.71 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  26.28 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  30 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  30 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.97 
 
 		 671 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.2 
 
 		 664 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  30.61 
 
 		 221 aa  44.7  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3981  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2977  hypothetical protein  25.83 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  23.53 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  30.28 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  24.39 
 
 		 241 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  25.66 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  27.4 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  25.95 
 
 		 682 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  23.94 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 682 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0612  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.833845  normal  0.0113808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 214 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  28.26 
 
 		 220 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  27.89 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  27.89 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  27.89 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  27.89 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  27.89 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.2 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.89 
 
 		 219 aa  41.2  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  26.03 
 
 		 202 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  24.18 
 
 		 218 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>