More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1744 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1744  DedA family membrane protein  100 
 
 		 166 aa  320  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0059834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1475  dedA protein  100 
 
 		 166 aa  320  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.937039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  49.69 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  49.07 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0447  DedA family protein  48.8 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0457  DedA family protein  47.59 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00277812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  37.58 
 
 		 207 aa  103  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  37.04 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  37.4 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.5 
 
 		 228 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.72 
 
 		 217 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  30.67 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0884  DedA family protein  32.89 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  34.23 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  32.24 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.06 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  33.58 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  31.01 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  29.34 
 
 		 325 aa  77.8  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  34.72 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  32.65 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  33.1 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  32.59 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  31.82 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  35.15 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  31.94 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  30.91 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  30.91 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  30.19 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  32.77 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.03 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  30.18 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  29.93 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  30.28 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  29.93 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.77 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  30.28 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  29.71 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  30.28 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  30.28 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.15 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  27.27 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.12 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  32 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  29.93 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  29.09 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  29.93 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  29.93 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  28.12 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  31.79 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.12 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  28.29 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.99 
 
 		 211 aa  70.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.3 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  28.65 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  27.5 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.49 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  33.58 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  27.71 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.49 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.58 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  31.21 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.01 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.38 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  31.65 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.86 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  28.05 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.71 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  32.37 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  31.11 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  32.88 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  33.53 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  28.83 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.63 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  32.88 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.63 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  28.97 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  31.68 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  31.68 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  31.29 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.63 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  30.63 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.63 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26.88 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>