249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1408 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1408  membrane protein  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02660  hypothetical protein  56.77 
 
 		 431 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0339  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.37 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  30.47 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  29.73 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  31.34 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  33.08 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  30.47 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.06 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  33.59 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  32.26 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.25 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  31.06 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  29.71 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  29.69 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  29.69 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.2 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  33.59 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  30.41 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  24.71 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  30.77 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  30.77 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  28.81 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  28.86 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  30.23 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  30.25 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  27.91 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  32.31 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  27.81 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  33.59 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.59 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  26.71 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  30.12 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  29.73 
 
 		 695 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  29.37 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  33.33 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  29.05 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  30.72 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  28.68 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  28.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  31.51 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  26.52 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  28.79 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5807  SNARE associated Golgi protein  27.48 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468515  normal  0.433949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  28.38 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0500  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.45 
 
 		 259 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  31.62 
 
 		 255 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  30 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  27.03 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.27 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  26.45 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.47 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02882  conserved inner membrane protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0690  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  32.48 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3417  hypothetical protein  29.25 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3545  SNARE associated Golgi protein  29.25 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0687  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2946  hypothetical protein  29.25 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.787334 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  28.79 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  28.68 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  32.37 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  32.37 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>