More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0210 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  81.74 
 
 		 241 aa  354  5.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  59.47 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  51.82 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  49.33 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  50 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  42.93 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  37.22 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  37.22 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  37.22 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  41.4 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  37.22 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  38.36 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  36.77 
 
 		 219 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  37.61 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.22 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  43.24 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  40.19 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  36.62 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.62 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  36.62 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  36.62 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  36.62 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  36.62 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  37.78 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  40.93 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  36.89 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  36.28 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  35.92 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  35.92 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  40.84 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  43.46 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  36.61 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  34.23 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  36.07 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  33.93 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  39.5 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  36.41 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  35.02 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  35.57 
 
 		 268 aa  138  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  37.19 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  36.56 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  35.14 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  36.56 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  36.56 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  39.52 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  38.74 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  45.95 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  34.09 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  40.21 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  38.62 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  40.53 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  38.25 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  39.11 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  33.93 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  39.66 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.27 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  36.84 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  38.25 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  38.74 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  35.9 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  42.19 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  38.81 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  39.47 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  36.65 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  36.62 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  35.02 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  36.27 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  39.04 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2641  SNARE associated Golgi protein  41.24 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  38.22 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  36.9 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.91 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  40.11 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  38.33 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  37.72 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  36.55 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  36.55 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  40.11 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  38.81 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.04 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  38.81 
 
 		 283 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  40.31 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  39.18 
 
 		 201 aa  121  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  38.81 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  38.81 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  38.83 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  38.54 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  38.81 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  39.69 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.17 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  40.62 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  38.81 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  38.81 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>