246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1217 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  86.27 
 
 
251 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  42.51 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  44.21 
 
 
209 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  40.11 
 
 
215 aa  131  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  36.36 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.83 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  39.29 
 
 
228 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  36.1 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  42.68 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  32.47 
 
 
241 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  37.67 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  30.53 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  36.31 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  36.31 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  36.31 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  31.98 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  32.87 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  31.95 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  30.71 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  30.22 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  25.32 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.82 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.85 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  27.64 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  26.63 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  28.64 
 
 
204 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  30.15 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  30.15 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  30.15 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  30.15 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  30.15 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  26.14 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  25.62 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  30.37 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.14 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.14 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  29.65 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  29.15 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  29.65 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  25.73 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  25.12 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  26.15 
 
 
216 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  26.15 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.41 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  25.79 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  22.86 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  26.32 
 
 
221 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  25.96 
 
 
363 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  24.56 
 
 
224 aa  55.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28.66 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.66 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  28.66 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  25.66 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.13 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  25.79 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  27.84 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  24.59 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  27.81 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  24.87 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  28.18 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  25.61 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  25.61 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  23 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.01 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  24.35 
 
 
227 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  25.97 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  25.67 
 
 
253 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  25.16 
 
 
219 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  27.33 
 
 
223 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  28.42 
 
 
223 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0497  hypothetical protein  29.93 
 
 
239 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.73 
 
 
521 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  26.58 
 
 
201 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  24.85 
 
 
222 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  28.48 
 
 
204 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  25.11 
 
 
232 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  30.54 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  25.73 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  26.29 
 
 
219 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  24.88 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.06 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0537  DedA family protein  29.86 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  26.72 
 
 
212 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  23.67 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  25.51 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  27.37 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>