132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.1 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  35.68 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  33.06 
 
 		 242 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  37.25 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  32.82 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  36.19 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  36.15 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  37.82 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  39.88 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  37.65 
 
 		 205 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  34.74 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  35.5 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  30.91 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  37.5 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30.91 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30.91 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.36 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.64 
 
 		 217 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  22.28 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.64 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  27.93 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  24.41 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  31.82 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.62 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1854  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  28.12 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  24.44 
 
 		 216 aa  52  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  27.05 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  26.99 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  25.41 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  30.73 
 
 		 202 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  25.3 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  25.64 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  30.06 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  23.12 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.5 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  27.08 
 
 		 192 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  27.96 
 
 		 191 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  26.7 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0605  hypothetical protein  25.37 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0553008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  27.85 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  25.82 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  26.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  26.42 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  25.11 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  25.9 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  26.76 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.55 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.8 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  25.76 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  32.58 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  24.52 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  24.46 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  24.46 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  24.46 
 
 		 189 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  24.46 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  24.46 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  31.39 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  23.5 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  22.17 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.58 
 
 		 228 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  30.66 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  30.11 
 
 		 184 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 222 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  25.48 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1745  DedA family protein  23.42 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0507809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1476  alkaline phosphatase-like protein  23.42 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  33.79 
 
 		 471 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  27.47 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  29.17 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  25.36 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  23.04 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  27.93 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  25.19 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  25.19 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  25.88 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  23.45 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  27.93 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  22.58 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  24.63 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  24.88 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  23.66 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>