More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5260 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  100 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  51.71 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  43.75 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  42.33 
 
 		 205 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  41.52 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  39.26 
 
 		 200 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  39.26 
 
 		 200 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  39.26 
 
 		 200 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  38.2 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  40.34 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  40.94 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  36.65 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  32.47 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  37.5 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.02 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  37.63 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  31.93 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  27.57 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  33.52 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  30.61 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  28.66 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30.1 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.59 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30.1 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  34.38 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.1 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  27.43 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  28.4 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.61 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  28.4 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.72 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  37.8 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.23 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  31.28 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  29.94 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  31.28 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  29.67 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  31.28 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  28.4 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  32.78 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  31.47 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  28.89 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  28.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  32.54 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  31.17 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  26.92 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  28.79 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  28.12 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  32.95 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  29.8 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  30.18 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  30.3 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  31.03 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  30.69 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  31.22 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  28.16 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  30.84 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  30.84 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  25.82 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.75 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  30.84 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  30.84 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  34.25 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0340  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.16 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  30.16 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  29.19 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  29.76 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  30.6 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  26.19 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  25.82 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  30.4 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  33.95 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  30.99 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  33.9 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  29.17 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  32.02 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  32.24 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  33.12 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  28.83 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.03 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  30.12 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>