194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1316 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  82.12 
 
 		 201 aa  308  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  64.04 
 
 		 203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  63.37 
 
 		 197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  60.69 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  60.12 
 
 		 198 aa  228  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  59.22 
 
 		 204 aa  227  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  60.12 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  57.65 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  35.8 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  32.72 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  33.33 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  37.41 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  35.98 
 
 		 190 aa  104  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  36.24 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  38.41 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  35.25 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  33.09 
 
 		 212 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  30.38 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  33.54 
 
 		 193 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  33.07 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  33.57 
 
 		 204 aa  85.1  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  32.32 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  30.2 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  33.57 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  31.82 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  33.97 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  33.57 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  27.56 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  27.56 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  32.03 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  32.86 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  32.86 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  32.86 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  31.21 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  27.39 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  26.28 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  26.51 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  29.14 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  36.94 
 
 		 218 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  28.99 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  28.99 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  28.99 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  28.99 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  28.99 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  26.81 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  26.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  33.9 
 
 		 241 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  32.41 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  32.41 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  27.38 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  24.58 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  24.65 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.38 
 
 		 668 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0557  DedA family protein  28 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.565091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  23.78 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  23.91 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 664 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  25.19 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  24.05 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  25 
 
 		 681 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  24.43 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  24.43 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  24.43 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  23.57 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  22.75 
 
 		 678 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  24.44 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  22.93 
 
 		 678 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  24.29 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  27.88 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  24.07 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  30.66 
 
 		 345 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  25.29 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  23.17 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.09 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.66 
 
 		 438 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  30.19 
 
 		 332 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.27 
 
 		 469 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.56 
 
 		 457 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  24.73 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  23.17 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  25.76 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  22.56 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0242  hypothetical protein  25.81 
 
 		 684 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  22.22 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  22.79 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  27.45 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5208  SNARE associated Golgi protein  24.44 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  23.4 
 
 		 202 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  22.22 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>