More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0679 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  78.17 
 
 		 203 aa  323  8.000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  79.19 
 
 		 198 aa  321  6e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  79.19 
 
 		 198 aa  319  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  78.17 
 
 		 198 aa  316  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  69.04 
 
 		 204 aa  292  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  62.44 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  63.37 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  55.03 
 
 		 229 aa  206  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  36.87 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  43.4 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  35.68 
 
 		 189 aa  125  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  36.26 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  32.61 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  42.14 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  39.49 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  36.59 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  37.27 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  35.75 
 
 		 190 aa  115  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  35.98 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  34.73 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  36.18 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  37.06 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  28.11 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  37.21 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  29.14 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  27.84 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  31.93 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  27.84 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  34.67 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  34.67 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  33.56 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  36.36 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  36.36 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  33.81 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  30.28 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  32.89 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  30.28 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  32.89 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  33.8 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  29.31 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  29.58 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  29.79 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  29.79 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  29.79 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  29.79 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  31.06 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  32.89 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  32.21 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  27.74 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  26.51 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  24.85 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  26.34 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.24 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  26.88 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  26.74 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  26.17 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  25.71 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  25.58 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  23.67 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  25.44 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1333  dedA family protein  27.17 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.914504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  25.45 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25 
 
 		 521 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 		 671 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  25.12 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  25.41 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  27.04 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  27.07 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1851  SNARE associated Golgi protein  25.54 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  26.67 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.22 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  25.44 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  22.66 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  22.66 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  28.37 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.09 
 
 		 668 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  28.49 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>