240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1695 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  100 
 
 
190 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  55.91 
 
 
187 aa  207  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  51.34 
 
 
189 aa  204  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  51.61 
 
 
189 aa  204  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  46.81 
 
 
189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  47.57 
 
 
185 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  47.03 
 
 
185 aa  175  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  47.03 
 
 
185 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  44.92 
 
 
187 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  47.85 
 
 
185 aa  168  4e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  35.64 
 
 
201 aa  121  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  37.14 
 
 
198 aa  115  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  36.57 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  35.75 
 
 
197 aa  115  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  36.57 
 
 
198 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  35.84 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  34.39 
 
 
203 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  35.98 
 
 
179 aa  104  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  34.74 
 
 
229 aa  99.8  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  36.05 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  34.67 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  34 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  31.98 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  30.36 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  34.07 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  34.46 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  30.41 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  31.43 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  35.37 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  28.65 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  31.15 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  31.15 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  27.21 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  27.03 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  33.6 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  27.03 
 
 
206 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  25.81 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  24.58 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  24.58 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  24.58 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  27.59 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  24.58 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  24.58 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  27.34 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  26.9 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  28.45 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  28.47 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  28.47 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  28.45 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  28.45 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  28.47 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  28.08 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  23.81 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  26.98 
 
 
438 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  25.34 
 
 
195 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  26.32 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  23.26 
 
 
437 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  23.26 
 
 
437 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  27.61 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  28.95 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 
244 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  26.45 
 
 
199 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  23.02 
 
 
223 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.57 
 
 
215 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  25.21 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  28.79 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  28.79 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  26.09 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.24 
 
 
668 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  31.07 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  31.07 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  24.49 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  31.07 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  23.93 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28.06 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.06 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  23.88 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  28.06 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  28.69 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  25.19 
 
 
682 aa  48.9  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29.08 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>