More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0504 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  60.43 
 
 		 187 aa  245  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  60.43 
 
 		 189 aa  235  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  61.5 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  55.08 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  48.66 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  46.81 
 
 		 190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  48.65 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  48.11 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  48.11 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  36.87 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  34.64 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  35.2 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  34.64 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  35.43 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  40.4 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  37.04 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  37.57 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  36.42 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  34.38 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  29.59 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  34.91 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  28.33 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  29.89 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  30.43 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  29.55 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  29.73 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  29.73 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  31.29 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  26.86 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  29.25 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  29.25 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  33.6 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  33.6 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.01 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  29.75 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  26.03 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  29.14 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  25 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  27.03 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  23.73 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  23.73 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  23.73 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  23.73 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  23.73 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  27.66 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  26.35 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  29.37 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  28.35 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  24.8 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  27.12 
 
 		 681 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  24.8 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  24.8 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.81 
 
 		 676 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.92 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.71 
 
 		 668 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  25.15 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  23.23 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  23.87 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  26.32 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  25 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  27.91 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  28.14 
 
 		 682 aa  61.2  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  28.14 
 
 		 682 aa  61.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  25 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  26.36 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  25.58 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  26.36 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  25.16 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  26.47 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  27.33 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.57 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  21.85 
 
 		 695 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  24.53 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  27.44 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  27.44 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  23.17 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.35 
 
 		 438 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.06 
 
 		 457 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  25.9 
 
 		 677 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>