More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1474 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  79.5 
 
 		 212 aa  323  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  74.5 
 
 		 202 aa  289  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  65.69 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  65.33 
 
 		 212 aa  259  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  42.62 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  34.52 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  43.4 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  38.19 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  42.48 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  42.48 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  42.48 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  39.87 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  37.71 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  40.85 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  40.85 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  39.24 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  39.63 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  39.02 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  37.91 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  35.23 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  34.97 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  35.25 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  29.63 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.63 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  33.33 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  33.33 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  33.33 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  34.38 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  33.33 
 
 		 189 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  33.16 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  38.51 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  32.12 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  37.8 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  35.42 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  32.64 
 
 		 189 aa  92  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  33.76 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  32.52 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  27.32 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  34.39 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  42.28 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  42.28 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1332  integral membrane protein  32.92 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  30.56 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  32.95 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1695  integral membrane protein  30.41 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30.3 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  31.07 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0519  DedA family protein  28.57 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  33.52 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  29.94 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.32 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  30.15 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  32.59 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  29.48 
 
 		 681 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  29.41 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1344  DedA family protein  26.92 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240972  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1224  DedA family protein  26.92 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 		 668 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  31.4 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.14 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  33.74 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.08 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  26.29 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  32.59 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  31.18 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  26.6 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.45 
 
 		 702 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1293  dedA family protein  30 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.82 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.55 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.27 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  28.16 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  31.62 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  26.71 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  31.85 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  30.88 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  23.74 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.91 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  30.88 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>